由沉降速度方程可知,顆粒的沉降速度與其大小成正比,若為球形顆粒,則與其直徑的平方成正比;與顆粒和介質的密度差成正比。因此,顆粒越大,和介質的密度差越大,沉降速度越大。顆粒大小和密度差是壓細胞分離的基礎。
大多數亞細胞的大小和密度都存在明顯差異。細胞核zui大,直徑達4~12μm,密度zui大。膜囊泡zui小,僅0.05~0.4μm,衍生囊泡的大小和密度受勻漿方法和勻漿介質密度影響。線粒體直徑0.4~2.5μm,密度為1.19克/立方厘米,用臺式大容量離心機差速離心法容易進行分離。在這些亞細胞分離中顆粒大小起主導作用,但線粒體、溶酶體的大小和密度都有重疊,用常規方法難以分離。